b. Memerlukan air yang banyak.
Tinggi air pada bak penampungan rakit apung minimal 15 centimeter hingga 20 cm, semakin luas bak penampungan maka kebutuhan air akan semakin banyak.
c. Penyakit cepat menyebar
Jika satu tanaman dalam sistem rakit apung terserang hama, misal bacin akar yang disebabkan oleh basil atau jamur, maka jikalau dibiarkan penyebarannya akan cepat, untuk mengatasinya kalau sudah terlalu parah, seluruh air nutirsi dalam bak harus diganti dengan yang baru.